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来自海洋的危险毒素,可能带来抗癌新疗法!今日《自然》揭秘合成路径与抗癌机制

Image▎药明康德内容团队编辑

在自然界,生物毒素常常会带来致命的威胁,但也孕育着造福患者的无尽希望。基于蛇毒成分开发的药物已经用于治疗抗心血管疾病;“海洋杀手”芋螺毒液中的肽,成为了帮助人们止痛的良药……现在,一种来自毫不起眼的海洋生物的毒素,或许能为癌症治疗带来新的机遇。
2013年,科学家在一种拉丁名为Vulcanodinium rugosum的底栖双鞭毛虫体内分离出一类环亚胺类毒素,命名为portimine A(简称PA)。
当时,人们已经从不同的海洋微生物中找到了多种环亚胺类毒素,这类毒素一方面可能通过食物链富集在贝类等海产品中,威胁我们的健康;另一方面,它们强大的生物活性还预示着疾病治疗的潜力。遗憾的是,由于具有高度神经毒性,这些环亚胺类毒素难以为我们所用。
但PA是个例外。与已知的其他环亚胺类毒素截然不同,PA在面对多种癌细胞时有着强大的细胞毒性,但对生物个体的整体毒性却较弱,因此有潜力带来全新的癌症疗法。此外,最近的研究指出,PA可以在尽可能避免坏死性凋亡的情况下,选择性地诱导细胞凋亡。
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图片来源:123RF
5年后,科学家从V. rugosum中又分离出了另一种环亚胺类毒素:portimine B(简称PB)。有趣的是,尽管两者互为互变异构体(分子式相同但结构略有不同),但PB却不具备PA那样诱人的抗癌前景。因此,PA特异性杀伤癌细胞的基础,很可能就藏在两个分子的关键结构差异中。
然而,PA生物学活性的机制仍是未知数,一个重要原因是人们尚无法得到足量的portimine材料用于分析。在自然界,双鞭毛虫生物合成的portimine含量十分有限;而在实验室里,可规模化的化学合成也因为portimine复杂的结构而受挫难以实现。
在刚刚上线的一篇《自然》杂志论文中,斯克利普斯研究所Phil Baran教授领导的研究团队带来了重要突破。最新研究实现了portimine的可规模化合成,并且进一步揭示了PA具有抗癌活性的结构基础以及作用机制,提出了癌症治疗的潜在新靶点。汤俊宸博士和李伟超博士为论文共同第一作者。
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研究团队首先要解决的,自然是portimine合成的难题。受合成萜类化合物的两相途径(two-phase strategy)启发,研究团队开发了创新性的合成路径,完成了这项极具挑战性的工作。为此,作者首先构建了最低氧化态的碳环;随后依次添加官能团,构建出氧化态的目标分子。利用这一策略,研究团队成功合成了PA、PB以及其他类似物。
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▲PA和PB的分子结构,其中基于最新化学合成结果,对报道的PB结构进行了修改(图片来源:参考资料[1])
该研究证实,合成的PA对多种种癌细胞系具有高度的细胞毒性,并且不会杀伤正常的人外周血单核细胞,具有优秀的选择性。此外,在小鼠试验中,PA也有效抑制了肿瘤的生长。
基于对合成结果的分析比较,研究明确了PA对癌细胞毒性的来源。作者指出,5号碳原子(C5)处的羟基立体构型对于分子活性至关重要,因此PA是一个独特的立体选择性化合物。而C5构型相反的PA异构体,细胞毒性明显更低。
因此,如果有蛋白与PA强烈互作,但不与C5构型相反的异构体互作,那么这类蛋白就很可能是PA的靶点蛋白。基于这一思路,研究团队利用蛋白质组学实验,找到了唯一一种符合条件的蛋白:NMD3。NMD3是核糖体60S大亚基的出核转运蛋白,这项研究首次找到了特异性靶点NMD3的小分子配体。
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▲PA和PB的全合成途径(图片来源:参考资料[1])
随后的研究提出了PA杀伤癌细胞而非正常细胞的可能解释。NMD3与PA的互作阻碍了核糖体聚集形成多核糖体的过程,从而抑制了新生蛋白的合成。因此,对繁衍与生存至关重要的蛋白(例如MYC和MCL-1)表达受到阻碍,最终导致细胞凋亡。相比于正常细胞,上述通路在癌细胞中尤其活跃,因此表现出了选择性。
对于接下来的研究计划,李伟超博士表示,研究团队一方面将结构优化工作,以期得到更好的体内结果;另一方面将探索PA影响哪个stage的核糖体60S大亚基,从而详细解析这一特殊机制。此外,研究团队猜测portimine可能是一种分子胶,或是能进行可能的PROTAC改造,因此未来的研究将继续探索portimine作为潜在癌症药物以及蛋白降解疗法的可能性。
参考资料:
[1] Tang, J., Li, W., Chiu, TY. et al. Synthesis of portimines reveals the basis of their anti-cancer activity. Nature (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-023-06535-1

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