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使用R语言复现Nature大子刊图

✅这张冲击图/桑基图(Alluvial Plot)展示了10位黑色素瘤患者(编号为Pt. 1至Pt. 10)的样本分析结果,每个图展示一名患者。图表从两个视角展示肿瘤反应性(Tumor Reactive, TR)细胞和克隆的分布情况: 🔸X轴方向表示两种分类维度: 左侧"clones"代表不同的T细胞克隆(每个克隆有唯一的CloneId标识)。 右侧"cells"代表根据肿瘤反应性和抗原特异性划分的细胞类别(包括"TR+ Orphan"、"TR+ Deorphan"、"TR- Orphan"、"TR- Deorphan")。 🔸Y轴方向表示细胞数量,每个克隆或类别的条形宽度直观反映了其细胞数量的多少。 🔸颜色含义: 红色系表示肿瘤反应性阳性(TR+)的细胞; 蓝色系表示肿瘤反应性阴性(TR-)的细胞。 🔸颜色深浅表示抗原特异性: 深色("Deorphan")代表抗原特异性; 浅色("Orphan")代表未知特异性。 🔸分面布局,图表被分成10个子图,每个子图对应一位患者。这种布局便于分别观察每位患者内部的细胞和克隆分布特征,同时也方便在不同患者之间进行对比分析。 @pythonic生物人推荐阅读👍: 复现IF40+期刊上18张图,换数据即可用! 复现Science正刊图,换数据即可用! 可视化三剑客:ggplot2 + Matplotlib + Seaborn 《保姆级R可视化教程》来了! Python matplotlib保姆级教程 嫌Matplotlib繁琐?试试Seaborn! 复现Nature子刊上3张图,换数据即可用! 复现Nature“水”子刊上配图,换数据即可用! 喜提“Acceptance”,多亏这两张图,能顶60张图的工作量! 复现Nature正刊上3张图,换数据即可用! 复现IF50.0期刊上6张图,换数据即可用! 复现中科院IF 25.9期刊上3张图,换数据即可用! 复现Nature子刊中的2张图,换个数据即可用! 复现IF 48.5的期刊图,这个图帮你省下50%版面费! 喜提“Major Revision”,太多图,被质疑在堆工作量...... 审稿人:凭这个3D Heatmap,必须给minor revision