pythonic生物人

复现IF 48+期刊图,换数据即可用!

本次使用R语言复现一下Nature图!

❤️复现效果图❤️
❤️复现效果图❤️
  • 箱线图显示了六个模型在训练集(training,第一行,n = 147例)和验证集(validation,第二行,n = 75例)中,跨越不同RCB类别所获得的预测因子评分的分布情况。
  • 箱体部分表示四分位距,其中的中线为中位数,须线延伸至箱体外部最大为四分位距1.5倍的范围,异常值以圆点表示。P值为双侧检验结果,并经过FDR校正的Wilcoxon秩和检验得到。

✅读入测试数据,

Image

✅关键代码,

ggboxplot(
  data = barfacet_data, 
  x = "RCB.category", 
  y = "value", 
  fill = "RCB.category",
  outlier.size = 0.5,
  facet = c("Class", "pipeline") # 按两个变量分面
) +
# 添加p值
  stat_pvalue_manual(
    statistical_test, 
    hide.ns = FALSE,
    label = "p.adj.short"
  )
Image

x轴方向按照pipeline分面为6列,y轴方向按照Class分面为2列。


✅值得学习的R可视化知识点:

  • 添加p value的方法wilcox_test;
  • 添加分面的方法facet;
  • 自定义主题的方法theme。

本期结束!


数据+详细代码👇

(备注:299)

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复现效果图-abcd图❤️
复现效果图-b图❤️
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❤️复现效果图-ABCD图❤️
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❤️复现效果图-bcd图❤️
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❤️复现效果图-b图❤️
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(加入学习,收费,备注:299)

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