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打破认知!《细胞》子刊:RNA出现在意想不到的地方,还能调节免疫

在传统认知中,RNA(核糖核酸)在细胞内参与信息传递或特殊的功能执行过程。例如,信使RNA(mRNA)负责传递遗传指令,核糖体RNA(rRNA)是蛋白质合成的核心。然而,近年来的科学研究正在颠覆这一传统观念。有研究在多种哺乳动物细胞表面检测到了RNA的踪迹,包括mRNA、长链非编码RNA等。但科学家们尚不清楚这些RNA如何在细胞外稳定存在,又发挥着哪些功能。

在最近发表于《分子细胞》(Molecular Cell)的研究中,科学家发现细胞表面RNA会与RNA结合蛋白、硫酸乙酰肝素形成三元复合物。这种复合物可以稳定与细胞结合,并且招募免疫检查点分子,用于抑制或激活免疫反应。这也表明,RNA可能是免疫调节中一种全新的关键元件。

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研究中,作者首先选取了一种能特异性、高灵敏度检测活细胞表面RNA的分子——Toll样受体7(TLR7)。TLR7是免疫细胞内的一种模式识别受体,专职识别内源或外源的单链RNA。研究者利用TLR7作为“分子探针”并配合荧光标记,在显微镜下清晰地看到了细胞边缘呈现点状聚集的RNA信号。而当用RNA酶处理细胞后,这些信号则几乎完全消失了。这表明,TLR7探针检测到的确实是细胞表面的真实RNA。

为了确认这些RNA是如何稳定保留在细胞表面的,作者进一步借助CRISPR/Cas9技术对细胞基因进行了敲除筛选。该策略可用于揭示哪些基因的缺失会导致细胞表面RNA信号大幅减弱。

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▲研究示意图(图片来源:参考资料[2])

筛选结果指向了一个方向:硫酸乙酰肝素(HS)的生物合成通路。HS是广泛存在于细胞表面和细胞外基质中的一类线性多糖链,能够富集和锚定多种蛋白质。而敲除合成HS链的关键酶或修饰相关的酶,细胞表面的RNA信号会急剧下降甚至消失。因此,完整的HS链及其正确的硫酸化修饰,是RNA能够稳定存在于细胞表面的必要条件。

不过,RNA和HS都带有极强的负电荷,本身会相互排斥,两者还需要一个中间分子来进行连接。后续分析也找到了这个关键的连接分子——RNA结合蛋白。这些过去被认为仅存在于细胞核或细胞质中的蛋白,竟然也出现在了细胞表面,并与RNA、HS共同构建成了三元复合物。

这些复合物与细胞表面糖蛋白PVR位置非常接近,PVR是重要的免疫检查点分子,能与多种免疫细胞上的受体结合,从而抑制或激活免疫反应。他们测试了四种已知的PVR结合受体,发现其中一个名为KIR2DL5的抑制性受体,其结合显著依赖于细胞表面的RNA三元复合物。

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图片来源:123RF

尽管PVR本身与KIR2DL5的亲和力较弱,但大量RNA三元复合物存在于PVR周围,像“分子胶水”一样将KIR2DL5高浓度地富集在细胞表面特定区域。这能够促进KIR2DL5与PVR的有效结合,强化了免疫抑制信号。

新研究不仅揭示了细胞表面RNA稳定存在和发挥功能的核心机制,还改变了我们对RNA细胞定位和功能的传统认知。RNA从一个细胞内信使的角色,扩展到了细胞间通讯的直接参与者。这也将为理解免疫机制,甚至免疫相关疾病带来新的启示。

参考资料:

[1] Zeshi Li et al, Cell-surface RNA forms ternary complex with RNA-binding proteins and heparan sulfate to recruit immune receptors, Molecular Cell (2025). DOI: 10.1016/j.molcel.2025.11.020

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