饶议科学

不会科学也能研究:聪明的捷径与愚笨的做法

题目的比喻(不会科学也能研究)有两种情况,一种是聪明人的捷径、一种是愚蠢者的做法:
一种是如今我国一大批科学还没搞懂的,抓一个现成的“什么”就冲上去,似乎也能在出产大批垃圾的过程中出现真东西,非常有趣;
一种是类比“熟读唐诗三百首 不会作诗也会吟”,如大量阅读文献、经常听学术报告,耳濡目染杰出科学家的品味,艰苦朴素蹒跚学步科学研究,也很好玩。
笨鸟靠努力
笨人只能用第二种办法。
1985年至1991年在旧金山加州大学期间,是我听学术报告最多、收获最大的时期,其周二下午生物化学系列含分子生物学、生物化学、遗传学和发育生物学等,周四下午神经生物学是神经科学,周一细胞生物学含细胞生物学和信号转导等。
除学科集中外,UCSF校园小成为学术活动的优点:地点集中,HSW的三楼大教室,7楼生理系教室、8楼生化系教室,药理系的教室也不远,记不清几楼了。
也可以去伯克利加大生物系、斯坦福大学医学院和生物系听学术报告,参加学术会议。
自从离开旧金山,就一直处于学术饥渴,就是在哈佛也感到没有足够的学术报告,因为校本部生化分子生物系、细胞与发育生物学系的报告数量不够多,需要去MIT和哈佛医学院,虽然有校车,不如UCSF都在几栋楼之间方便。
华盛顿大学医学院的学术报告方便,基础医学的基本在一栋楼(南楼),临床医学的也不错且距离不远,内科系、神经内科系都有很好的。1990年代,华盛顿大学神经内科对于确立阿尔兹海默症(AD)的诊断标准有贡献。华盛顿大学的生物系也偶有很好的学术报告,需要坐校车去。
西北大学的高质量学术报告比以上三个学校少很多。
以下笔记本为1994年在哈佛听的最后几个学术报告,和1994年10月24日至1998年2月9日记录的在华盛顿大学期间听的学术报,和有些学术会议的内容。
我在华盛顿大学医学院的系以前称为解剖系,中国古人类/体质人类学之父吴汝康于1949年在解剖系获得博士学位。他的论文还在系里保存。我在该系的时候,它为“解剖与神经生物学系”,有两位教授教医学生的解剖,其他人研究神经生物学,不参与解剖学教学。现在这个系称“神经科学系”,估计功能与之前类似。
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前面4页为1994年还在哈佛时期去参加学术报告的笔记。
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第四页MTL于1994年的重要发现,在当年两次听他讲。
以下为1994年到华盛顿大学之后的学术笔记,从10月24日开始:
David Van Essen是神经生物学系主任
11月3日的Hunt Willard是遗传学家,讲X染色体失活。
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11/4 遗传学系的Tim Schedl讲线虫种系发生细胞
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1994年11月4日,同系的Karen O'Malley教授讲如何基因治疗帕金森病。讲了当时比较几种病毒外壳:RSV、HSV-1、AAV。
以后AAV是最常用的,全世界的实验室、基因治疗企业的主流。
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1994年11月7日,UCLA的Larry Zipursky讲果蝇视觉系统神经投射。
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1994年11月9日,UCSD的Jean Wang讲cAbl于癌症。
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1994年12月5日,FAS和TNF受体
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1994年12月7日,Young Oh讲bcl-2
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1994年12月19日,哈佛的Steve Younkin讲剪切APP的水解酶(secretases)
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1995年2月3日,药理学系(后改发育生物学系)Kerry Kornfeld讲线虫发育:
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1995年2月6日,当时在Roche分子生物学研究所的Tom Curran来华盛顿大学讲 fos基因(以后是活性极早标记基因)
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1995年3月6日,哥伦比亚大学Tom Jessell(1951-2019)来华盛顿大学生物系讲Hedgehog基因于脊髓发育。他是英国科学家,研究生期间1977年发表一篇Nature,提出吗啡在脊髓镇痛的机理。在哈佛工作后长期在哥伦比亚大学医学院工作。后来长期研究脊髓发育的分子机理。研究好,口才看,英国英文更加加分,被美国人广为认为是才华横溢。所以,我也在旧金山、哈佛和华盛顿大学都多次听他学术报告。他也曾是Kandel《神经科学原理》最年轻的主编。2018年因为出问题被撤职,又很快因神经退行性疾病而于2019年去世。
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1995年3月30日,Dallas的Steve McKnight讲IL(白细胞间素)通过STAT信号转导
MIT的Harvey Lodish讲EPO红细胞生成素受体信号转导
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1995年4月8日,哥伦比亚大学Eric Kandel讲钙调蛋白激酶参与长时程增强作用(学习记忆模型)。他是神经科学大家,权威教科书作者,而且很会讲。也是很多地方请,我在每一个地方听过。
但是,他一次都不来中国。
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旧金山加州大学Roger Nicoll
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Bruce McNaughton
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Sean Carroll
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1995年4月13日,MIT的Leonard Gurente,用酵母研究衰老
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华盛顿大学神经内科系主任Dennis Choi,从Stanford大学起就已经谷氨酸引起神经细胞死亡,在华盛顿大学任系主任多年。后来去药企,而不顺利。他父亲是朝鲜人,母亲是中国人。
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Eileen White、Kevin Roth
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1995年4月27日,MGH来的某科学家APP与什么蛋白质相互作用。
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1995年4月27日,Craig Thompson讲细胞死亡
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Princeton的Tom Shenk 极早基因
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1995年8月18日,华盛顿大学的Rafi Kopan给大家讲Gordon会议上记录的进展。
Rafi、Ross Cagan和我三人来自不同背景。Rafi是以色列人,在西雅图的Harold Weintraub实验室做过博士后(Weintraub发现决定肌肉的MyoD,如果没有因为癌症去世,可能会获诺奖)。Ross是Larry Zipursky的博士后。
我们前后一两年到华盛顿大学医学院不同系任教,都研究发育的分子机理,Ross一直用果蝇,Rafi当时想要蛙,但实际没有,我当时是用蛙。
我们三人一拍即合,经常在一起讨论科学进展,不仅自己而且全世界的进展。创立当时华盛顿大学医学院研究生最多的选修课Molecool(酷分子,讲参与重要生物学过程的重要分子)。几十年后我在中国还收到美国教授来信,当年是课上的学生。
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1995年Duke大学医学院神经生物学系主任Dale Purves
11月7日我怎么把实验室组会记在这个笔记本了
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1995年12月14日,遗传学系Jim Skeath,果蝇神经发育
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1996年1月18日,Frank McCormick(那时好像在Genentech?)ras癌基因,信号转导
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1996年3月1日,哈佛的Steve Younkin,APP与AD
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1996年3月23日Joel Permultter帕金森病
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1996年3月23日,Wisconsin大学Sean Carroll果蝇翅膀发育,最后谈到蝴蝶。他以后研究发育的进化生物学
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1996年4月2日,Duke大学医学院的Allen Roses讲APOE
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1996年6月29日至7月3日,参加Santa Cruz会议,发育生物学:
普林斯顿Trudi Schubach,果蝇(她的先生Eric Wieschaus是诺奖得主,但他们两人基本很少合作研究);
纽约大学的Ruth Lehmann(她是德国科学家,在MIT工作一些时间后,去NYU);
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UCLA的Eddy De Robertis,蛙的发育
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哈佛的Liz Robertson,斑马鱼
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斯坦福的Mark Krasnow,果蝇气管发育的基因。当场有人认为最有趣。这人曾任细胞主编。
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Andy McMahan
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Roel Nusse
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1996年6月30日,伯克利的印度裔Nipam Patel
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1996年7月1日,华盛顿大学的Jeff Lichtman
UCSF的Ira Herskowitz,UIUC的Ray Keller
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UCSF的Marc Tessier-Lavigne
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1996年7月2日,伯克利的Gerry Rubin,他年轻时发明果蝇P因子介导的转基因技术而在36岁当选美国科学院院士。
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Barbara Meyer,线虫性决定
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加州理工学院的David Anderson
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Salk的Chris Kintner
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UCSF的Cori Bargmann,她在MIT研究生期间研究癌基因,博士后开始研究线虫嗅觉的基因,后来长期研究
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纽约大学的Steve Burden
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洛克菲勒大学的Charles Gilbert
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UCSF的Alison Doupe
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伯克利的Richard Harland
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英国的Phil Ingham
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Rosa Beddington
Mike Levine
1996年8月22日非洲爪蟾会议
Ralph Rupp,Dana Carroll,Kristen Kroll
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Enrique Amaya,
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M Klymkowsky
Michael Kuhl
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Tom Lallier
Carolyn Larabell
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Doris Wedlich
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Stephen Schneider
Francois Fagotto
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Janet Hesman
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Jingdong Tian
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Larry Elkin
Mary Lou King
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Igor Dawid
Kevin Lustig
Ken Cho
Malcolm Whitman (冯诺依曼的外孙)
Jonathan Slack
Abrahan Fainsod
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Julie Baker
Les Dale
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Tom Musci
Jim Smith
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David Kimmelman
Sue Godsave
Yanzhen Cui
Brian Hyatt
Anne Knecht
Patrick Lemaire法国
Bruce Blumberg
Chris Kintner
Sergei Sokol
Steve Hoppler
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Lynn McGrew
Rob Grainger
Angie Ribera
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Roberto Mayor
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Horst Grunz
Hazel Sive (MIT)
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Rebecca Hartley
Alison Smith
Gert Jan Veenstra
Karen Symes
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Paul Krieg
Sherryl Sato
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Milan Jamrrich
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Roger Patients
Gerhart Ryffel
Christopher Niehr
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Tom Preler
Dan Weeks
Ruri Rungger
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Gerry Thomson
Hugh Weedland
Rosamund Smith
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Tom Moss
Marc Moreau
Amy Sater
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Michael Sargent
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实验室
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1996年10月24日,遗传学系Mark Johnston酵母葡萄糖调节基因
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1996年10月26日,David Rappaport视网膜发育
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E McClesky
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1996年11月 哈佛医学院生化和药理系Andrew Lassar,发育基因
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1996年11月7日,Paul Lask,极颗粒polar granule与基因调节种系发生细胞形成
华盛顿大学Stan Korsmeyer讲BAD的磷酸化。他研究Bcl-2与细胞死亡,为诺奖程度的研究,但不幸逝世于癌症。
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1997年1月10日,Tom Sudhof讲突触囊泡与突触前膜作用的蛋白质。他在Dallas和Stanford的工作,后来诺奖。他在中国有好些学生,近年仍然坚持经常来。
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1997年1月28日,卓敏
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1997 年2月6日,普林斯顿的Shirley Tighlman,她研究Xist
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1997年2月6日,洛克菲勒的Herman Steller果蝇细胞死亡基因
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1997年2月7日,我邀请耶鲁大学的Pasko Rakic到华盛顿大学药理学系学术报告。我不是药理系的教授,他们不知道怎么让我邀请过一次。因为神经生物学很强,Pasko自然认为是在神经生物学系讲报告,开场就说你们神经生物系多强,我马上提醒这是药理系,他接着说“那很快就要变成神经生物系”,这个玩笑让药理系主任很生气,以后再也不如外系的人请药理系的学术报告。
但是药理系在转型,实际成为发育生物系。
当时的药理系主任还很不确定自己的研究和自己的安全感,他研究小鼠肠道细菌,当时不被重视。后来他成为肠道细菌研究之父,享有盛誉。
但,1997年,如果没有人会比较肠道研究与神经研究,一般人(特别是全世界研究神经的庞然大队人马)理所应当认为神经永远是生物医学最重要的。没有预计到某些时间段肠道还有可以研究的重要问题,例如后来热得不得了的肠道细菌。
1997年2月10日,哈佛医学院遗传系Cliff Tabin,肢芽发育与Hh基因。上肢与下肢,发育过程非常有趣,其中一个关键是肢芽的局部有信号,第一个确定的是Hh,是果蝇发现的基因,而在哺乳动物有多种关键功能,其中一个是肢芽发育,这一功能在果蝇里面没有,只是保留的分子信号转导通路,而不参与果蝇的肢体发育。
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1997年2月22可能是到印第安纳州,一些华人生物教授可能是春节前后。
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于雷
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管坤良
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冯根生
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Jeff Gordon,肠道细菌:线虫、果蝇、小鼠
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1997年3月3日,瑞士Basel生物中心的Walter Gehring
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1997年3月11日,酷分子课的笔记:肾脏发育
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Rich Pierce:肺发育
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1997年3月18日,Bruce Hamilton
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1997年3月21日 Eric Frank脊髓发育
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华盛顿大学Dave Ornitz,那次是讲骨发育
他后来长期任发育生物系主任
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1997年4月14日Jeff Lichtman
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1997年5月1日,Marnie Halpern
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1997年斯坦福大学的Barbara Barres来华盛顿大学学术报告,我不得不承认当时认为她长相真不像女性。后来她做改变,成为男性,改名Benjamin。她/他科学很好,为人很好,不幸英年早逝。
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David McCormick
Robb Krumloff
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洛克菲勒的Mike Young,他长期研究果蝇生物钟的基因Period,2017年诺奖
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Tony Muslrun
Helen McNeil
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1997年10月16日,华盛顿大学医学院细胞生物与生理系Harris请王晓东给学术报告,笔记不全:里面有很好的笑话,包括if you show the CARD, the game is over(CARD是一个蛋白质的domain,gameover在此引申为细胞死亡)。
后面我参加了晚饭。
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1997年10月22日 Jaesob Kim,博士后找工作,后来回南韩
1997年10月23日Scott Argraves
1997年11月7日 ,Carla Shatz。她在Stanford,Harvard和Stanford工作,可能当时是哈佛神经生物学系主任。
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1997年11月13日  Helen Chamberlain
1997年11月17日 ,霍普金斯的Jeremy Nathans。他父亲是诺奖得主(限制性内切酶),他读研究生期间1986年发现色觉蛋白的基因,一直被认为回获诺奖,但迄今尚未。一些跟风他工作的工作早已获奖。
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1997年11月19日 普林斯顿的Steve Block
11月20日Alex Simon
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1997年11月24日 加州理工学院的Eric Davidson
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1997年12月1日 Ian Duncan
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1997年12月19日 Ann Marie Craig
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1998年1月8日 ,犹他大学的Mario Capecchi。他在1987年发明小鼠基因剔除的方法,已经广泛应用。我参加晚饭,问他问题的时候,引出他讲小时候在意大利的故事。他后来公开讲了这个故事。但是后来被证明是他太小出现记忆错误,故事不对。他发声明不是故意编故事。
他于2007年获奖。
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1998年1月12日 ,冷泉港的Ron McKay,他后来为人熟知的是Nestin。
1998年1月26日 ,哥伦比亚的Mike Levine。
1998年1月27日 , 斯坦福大学的Matt Scott,这时研究PTC(Patched)。这个基因编码的蛋白质是在细胞膜上,与Smothened共同组成Hh的受体。后继工作发现它们的功能机理非常有趣,是今天还有研究的重要分子。
1998年1月28日 ,Brian Howell。
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Who has a heavier accent? Him or me?估计是当时自己问自己,或提醒自己会议后问其他人。