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打破认知!《科学》:“垃圾DNA”有新作用,它们是癌症的隐形推手

在我们的基因深处,潜藏着一群特殊的成分——L1逆转座子。它们被认为是一类古老的寄生基因,能随意插入到基因组的新位置,以一种特殊的跳跃方式复制。这些DNA序列占据了人类核基因组的17%,却长期被科学家视为“垃圾DNA”。

如今,人体中的绝大多数L1元件都已经失活,失去了跳跃活性。但仍有150~200个L1元件维持了这种功能,成为基因组不稳定的潜在源头。过往一些研究已经发现,L1元件参与了多种癌症类型的发生,它通过促进细胞的基因组畸变,增强肿瘤的适应性。但科学家们仍然不清楚的是,L1元件是如何破坏基因组的。

最近,一项发表在《科学》杂志上的研究成功揭示了L1逆转座子的运作机制,以及对基因组的复杂影响。除了偶尔插入错误位置,破坏单个基因的表达,研究者还发现L1元件能够驱动大规模的基因结构改变,造成破坏性更大的基因组混乱,从而加速细胞的癌变。

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研究人员通过对137名癌症患者的肿瘤样本进行筛选,最终锁定了10个具有异常高水平L1活性的肿瘤。他们在这10个肿瘤中发现了超过6000次的体细胞L1逆转座事件。在单个肿瘤中,最多产生了超1300次L1逆转座事件。它们就像是不断在基因组中“随机插入”的变异,可能随时激活致癌基因或导致抑癌基因失活。

然而,L1逆转座子最危险的行为远不止是简单的插入。研究的大量分析案例中,L1元件插入直接导致了基因组的大规模重组,例如L1逆转座事件能够促进染色体平衡易位的发生。所谓平衡易位,是指两条不同染色体之间交换了片段,但遗传物质总量保持不变。这种异常是许多癌症类型的标志性特征。

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▲研究在肿瘤中发现的L1逆转座子事件(图片来源:参考资料[1])

以头颈鳞状细胞癌为例,研究者观察到一条18号染色体和一条20号染色体之间发生了精准的片段交换。深入分析揭示,这种交换是由两个独立的L1逆转座事件“合作”完成的——它们分别插入到两条染色体上,然后在DNA修复过程中形成了染色体的重新连接。

在另一例肺鳞状细胞癌中,情况更为复杂:两个不同的L1元件在插入过程中发生了自身倒位,最终形成了嵌合结构,同样促成了染色体易位。

进一步分析发现,大部分L1介导的重排在肿瘤演化早期就已出现。在一例肿瘤中,一个L1元件介导的平衡易位发生在患者确诊8年之前。这意味着,L1逆转座子激活可能是肿瘤发生的早期驱动因素,而非晚期混乱的结果。

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图片来源:123RF

研究发现,p53抑癌基因的双等位突变与L1逆转座活性增强相关。同时,DNA甲基化水平的降低也与L1元件激活密切相关。这可能正是推动肿瘤发生、发展的重要原因。

研究者指出,新发现改变了我们对癌症基因组不稳定性的理解。L1逆转座子也不再是所谓的“垃圾DNA”,而是能够主动塑造癌症基因组的活跃分子。研究者估算,平均每40~60次L1元件插入就会导致一次基因组重排。在高度活跃的肿瘤中,这一比例甚至更高。因此,抑制L1元件的活性或能成为癌症治疗的全新方向,有望帮助阻止肿瘤的进展。

参考资料:

[1] Sonia Zumalave et al, Concurrent L1 retrotransposition events promote reciprocal translocations in human tumorigenesis, Science (2026). DOI: 10.1126/science.aee4513.

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