如何分享实验方案并获得认可?五个步骤教你破局
不论您的研究主题是什么,详细的分步式实验方案都是理解研究结果的关键。
这些实验方案可能是特定实验的详细步骤、实验室/田野调查日常操作指南、计算工作流程,或是用于回答研究问题的方法框架。将这些内容开放共享有助于他人理解您的工作,并清楚再现、验证或在此基础上开展进一步研究所需的条件。它还能帮您达到资助机构和出版机构对开放科学的要求。
如何准备、发布、授权并引用您的实验方案,使其易于发现、使用并获得认可?本文将带你一探究竟。
减少试错,从写清楚实验方案开始
公开分享详细的实验方案能提高清晰度、易用性和可重复性,以便他人放心地采用您的方法。以无障碍格式记录完整的方法可解决研究中许多常见的痛点:
准确、全面地描述实验步骤,减少猜测。
明确列出依赖项(如试剂、设备、软件及其版本),提高研究的可重复性。
说明确切条件(如时间、温度或可接受范围),确保清晰度。
避免行话,使用简明的术语,确保可读性。
加入预期结果和简单的故障排除方法,防止读者陷入死胡同。
清晰地记录方法,将方便他人(包括未来的自己)更易再现或借鉴您的研究。分享实验方案还有助于丰富背景信息,以便他人准确解读和重复使用您的数据。
为什么要开发共享实验方案?
可重复的结果:完整的步骤、条件和材料让其他人(以及未来的自己)能够再现这项研究。
加快同行评审:清晰的方法可减少与编辑和审稿人的反复沟通。
合规:许多资助机构、科研机构和期刊鼓励或要求方法可访问、可重复使用。
重复使用与认可:模块化、内容完整且可引用的实验方案易于发现、重复使用并得到适当的认可。
群体益处:通过方法共享推动科学进步,惠及全社会。
如何共享您的实验方案
步骤一:准备实验方案
表述清晰:在描述步骤时始终使用主动语态(例如,不能写“a 25 µl reaction was set up containing”,而要写“set up a 25 µl reaction containing”),所有缩略语都要给出说明,每一步都要写的尽量简单直白。
内容完整:能够让其他人使用相同的资源可以逐步重复您的研究
包含全部要素:列出所有用到的材料、设备和资源(如试剂/仪器、数据集/档案、分析工具),在相关处注明供应商、型号、批号和RRID。附上配方和详细参数(如缓冲液配方;语料筛选规则)以及软件版本。
按时间顺序呈现步骤:每一步都应当包含所属领域中的重要条件(如温度、电压、采样率、阈值)、预期结果或临界点(如适用)。
提供指导:注明所需的专业知识、安全信息、伦理说明、限制条件和参考文献。
添加说明:
更易检索:为您的实验方案起一个准确且易于检索的标题,并加入三到四句话的摘要,简要说明该方案的用途、适用场景和预期结果。一定要添加相关的关键词。
提供小技巧:考虑是否还能补充一些有助于他人重复研究的要点。例如故障排除技巧和视觉内容(如教学短视频或关键步骤的图像)。
署名:确保所有参与制定实验方案的作者都得到适当的署名,实验方案的作者认定标准与研究稿件类似。实验方案的署名顺序通常与相关联的稿件不同,确保特定产出获得适当的认可。
寻求反馈:找课题组、系里的同事,或是请合作者对完整的实验方案进行检查。
步骤二:选择合适的平台
我们鼓励作者在他们选择的动态化平台上分享实验方案,如protocols.io。不同于静态Word或PDF文件,这类平台能:
允许您创建易于跟随的分布式实验方案。
提供DOI,实现实验方案的可引用和可查找。
支持版本控制。
整合了一些常用工具,如电子实验记录本(ELN)、云存储服务器和部分期刊投稿系统。
protocols.io是施普林格·自然旗下的数字化实验方案管理平台,研究人员可以在平台上在线查找、创建、管理、协作、共享并发布实验方案。借助标准化的流程描述、可追踪的版本变更以及清晰的执行记录,protocols.io有助于减少实验步骤的差异并提升可重复性。近期平台还推出了多个AI功能,助力实验更快更准。
protocols.io可免费创建和查找公开实验方案,高级功能则可满足实验室、高校和研发企业的不同需求。如果您对protocols.io感兴趣,欢迎扫码申请平台试用。
步骤三:确保长期可访问性
把实验方案当作一篇简短、模块化、自成一体的科学出版物。借助protocols.io这类提供DOI的平台,读者可在多年后检索到您研究方法的确切版本,同时您依然能不断对其进行更新。
为您的版本添加标签,以清楚地记录历史变更及变更原因。确保每个版本都有自己的DOI。
引用您的实验方案:将实验方案DOI链接到论文的方法部分,并在参考文献中单独列出,以确保可访问性。
步骤四:授权许可
版权许可协议能让他人明确该如何使用,以及在何种条件下使用您的实验方案。
选择一项知识共享许可协议,以最大限度释放重复使用潜力(这是您在protocols.io平台发布实验方案时的默认设置)。
确定您选择的实验方案平台是否有许可条款。
核实您的资助方是否要求使用特定的许可协议。
如果您的实验方案中使用了第三方的内容,请确认您在所选的许可协议下是否获准加入这些内容,并确保标明来源。
确保实验方案记录中包含许可信息。
步骤五:伦理与法律考量
和其他科研产出一样,以负责任的方式分享实验方案非常重要。
保护参与者和知识产权:删除机密信息和身份信息(如患者ID、敏感地点的GPS坐标、专有配方、商业秘密、安全密钥或可识别的人物照片)。
如果删去细节会影响某个步骤,请简要指出,并向读者说明如何继续推进(如使用合成数据,或受控访问)。
检查是否符合资助机构、科研机构和期刊的政策:部分研究必须遵循特定的报告标准(如MDAR、ARRIVE、CONSORT、PRISMA,以及特定领域的检查清单)。在您实验方案记录的相关处附上这些标准的链接。
快速检查清单
在公开分享实验方案之前,您可以对照检查是否做到下列事项:
实验方案完整且清晰
包含背景信息(标题、摘要和关键词)和故障排除方法
所有作者得到适当的署名
选择动态实验方案平台,DOI已分配
知识共享许可协议已添加
版本控制和变更日志已启动
实验方案DOI在所有相关稿件中被引用(包括方法和参考文献部分)
资助机构已致谢,参考文献已引用(如适用)
欢迎点击“阅读原文”访问官网了解详情
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