学术经纬

今日《自然》:全球数百万患者,这种疾病的致病谜团有望破解

在我们的身体里,尽管每个细胞都携带同一套DNA蓝图,但身体里的细胞可以分化成不同类型,并且互相支持。这是因为细胞之间对特定基因表达的调控不同,哪些基因开启表达,哪些被关闭都可能决定了细胞的走向。

除了细胞类型本身,许多复杂的疾病风险也与基因调控有关。比如哪些人更易患炎症性肠病(IBD)?遗传变异究竟是如何通过影响基因表达来增加患病风险的?

今日,一项发表在《自然》杂志上的研究为IBD的致病机制提供了前所未有的答案。研究团队通过对421名捐赠者的近220万个单细胞进行分析,绘制了迄今为止最大规模的肠道和血液单细胞遗传调控图谱。

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以往的基因表达调控研究大多采用“批量”分析,此方法会把组织中的各种细胞混在一起检测平均基因表达水平。

这种批量分析会遗漏大量重要的调控信号。当研究人员将细胞分辨率从“全组织”提升到“单细胞”时,他们发现了近30%的全新调控位点。

这些细胞类型特异的调控位点有几个鲜明特征:它们距离被调控的基因更远,更倾向位于增强子区域而非启动子区域,也很少调控距离最近的基因。

研究团队成功为超过一半已知的IBD遗传位点找到了可能的“效应基因”,其中包括74个从未被注释过的位点。更重要的是,他们不仅找到了基因,还指明了这些基因在哪些细胞类型中起作用。

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图片来源:123RF

总体来看,IBD发病机制中有着两条关键信号通路。

其中之一是Notch信号通路,它在树突状细胞中的异常调控与IBD风险密切相关。树突状细胞是免疫系统的“哨兵”,负责识别病原体并激活其他免疫细胞。研究发现,MAML2和ZMIZ1这两个Notch信号调控基因的表达变异,会增加溃疡性结肠炎和克罗恩病的患病风险。当树突状细胞中的Notch信号减弱时,可能导致肠道免疫耐受被破坏,引发过度炎症反应。

另外一条通路是Wnt信号通路,它在肠道上皮细胞中扮演关键角色。肠道上皮是人体与外界环境的第一道屏障,其完整性依赖于上皮干细胞的持续更新。研究发现,RASGRP1、MYC等多个Wnt通路相关基因的表达变异会影响上皮细胞的增殖和再生能力。当这条通路受损时,肠道屏障功能下降,可能诱发或加重炎症。

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图片来源:123RF

这项发现也找到了一些具备临床转化价值的靶点。研究团队发现,IBD风险位点包括ITGA4和JAK2,它们的表达调控变异都与IBD风险相关。目前,已经有针对这两个靶点的获批药物,这些药物或许能够帮助改善IBD的症状。

研究者表示,未来更大规模的单细胞研究将进一步完善这一图谱,帮助我们将更多遗传变异转化为可干预的疾病靶点。对于全球数百万IBD患者来说,这将是一个充满希望的治疗方向。

参考资料:

[1] Carl Anderson, Cell-type-resolved genetic variation shapes inflammatory bowel disease risk, Nature (2026). DOI: 10.1038/s41586-026-10627-z

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