审稿人:凭这个创意图,必须给minor revisions
一图胜千言,好的图表让审稿人如沐春风!
本期主角-3D Heatmap。
下面使用R简单实现3D Heatmap。
数据
使用“1.4.9 gene数据集”,
然后,用cor方法简单计算一下相关性。
R实现
ComplexHeatmap的frequencyHeatmap方法一行代码实现3D Heatmap。
## 19.1_01
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# @Author : 公众号:pythonic生物人
# @Desc : 19.1 3D heatmap图¶
library("ComplexHeatmap")
frequencyHeatmap(corr_matrix, use_3d = TRUE, col = brewer.pal(9, "Greens"), column_title = "3D Heatmap")
这个3D Heatmap通过表面高度和颜色展示了10个样本之间的相关性:
高度:z 轴高度表示相关性强弱(越高越强,例如 1.0;越低越弱,例如 0.3)。 颜色:从浅绿(低相关性,如 0.3)到深绿(高相关性,如 1.0)。
当然,我们可以换成自己钟爱❤️的配色,
获取绘图代码+测试数据+数据处理方法+依赖包安装方法,
👇(备注:299)