复现Nature“水”子刊上配图，换数据即可用！

本次使用R语言结合itol复现Nature Communications上的1张图！

图a通过系统发育树（Phylogenetic tree）结合热图和注释信息，直观呈现了小麦残体在不同氮处理（N0无氮输入 vs. N2高氮输入）下回收的68个宏基因组组装基因组（MAGs）的进化关系、分类学分布及生态动态：

最内层，系统发育树（Phylogenetic Tree）。展示68个宏基因组组装基因组（MAGs）的进化关系。按分类学门（Phylum）对分支着色，快速区分不同类群的进化位置。绿色实心区块表示ANI值<95%的新物种候选，提示潜在未描述的微生物多样性。

中间层，热图（Heatmap）。映MAGs在187天内对氮处理（N0 vs N2）的动态响应。

外层，质量指标条形图。评估MAGs的组装可靠性。蓝色条形图，表示完整度（Completeness），值越高（如>90%）表明基因组覆盖度越好，后续分析可信度更高。黄色条形图，表示污染度（Contamination），值越低（如<5%）提示交叉污染风险越小。

R准备itol的annotation数据

• ✅第0步，使用table2itol.R准备itol需要的annotation数据

• ✅第1步，选择树文件my.tre

这个是树的核心数据

• ✅第2步，Upload

• ✅第3步，设置为圆形树Circular

• ✅第4步，设置开口90度和树旋转

对比上一步的树枝角度即可清楚作用，

• ✅第5步，隐藏Labels

• ✅第6步，上传树的注释文件

• ✅第7步，进一步细化

可进一步借助PS或者AI工具处理下面图例部分，

本期结束！

测试数据+详细代码👇

（备注：299）