复现Science正刊图，换数据即可用！

pythonic生物人2025年10月08日约 2 分钟

本次使用R语言的两种方法，复现一下Science正刊中的几张图！

✅图表解读

该图为气泡图（Dot Plot），常用于展示单细胞RNA测序数据中特定基因在不同细胞群体中表达情况：

图表元素	代表含义	解读
气泡颜色	基因在细胞群体中的平均表达水平（经Z-score标准化）	越偏红色表示表达量高于该基因在所有细胞中的平均水平；越偏蓝色表示表达量低于平均水平；白色接近平均水平。
气泡大小	表达该基因的细胞在该细胞群体中所占的比例（百分比）	点越大，表示该基因在该细胞群体中表达越普遍。
Y轴（基因）	你要展示的基因列表	每个点代表一个基因。
X轴（细胞群体）	根据`celltype`划分的不同细胞群体（如"B细胞Normal", "T细胞Tumor"）	每个点代表一个细胞亚群。

注意，x和y轴有时候会交换。

一行代码，很简洁，需要输入Seurat对象，

# 方法1，关键代码
scDotPlot(
    object = dotsingle_data,           
    features = gene_list, 
    group = "celltype_group"
)

这里添加了xy轴上基因和细胞群的聚类树。

另外，推荐几组经典配色，

代码依旧很简单，

# 方法1，关键代码
jjDotPlot(object = dotsingle_data,
          gene = gene_list,
          id = 'celltype',
          split.by = 'groups'
         )

点可以使用不同的形状，

本期结束！

测试数据+详细代码，后期会加入👉《保姆级R可视化教程》

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