复现Science期刊图，换数据可用！
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pythonic生物人约 2 分钟
pythonic生物人约 2 分钟本次使用R语言复现一下Science正刊中的1张图！
如何读图？
该图为包珠图（Circular Packing），适用于展示具有层级结构的分类数据，其通过嵌套圆形的方式直观体现数据的层次关系。
原文中的上图作用：
展示在有利土壤（C）或抑病土壤（S）中生长的植物，其内生细菌群落的差异丰度情况。细菌群落的差异丰度分析基于从宏基因组中提取的16S rRNA reads。 圆圈的大小表示差异丰度类群的平均reads相对丰度，最大的圆圈代表门（Phylum）水平，其内的圆圈依次代表纲（Class）、科（Family）和属（Genus）。 在C与S土壤中，若在C中显著富集（FDR<0.1）则以红色标示，若在S中富集则以绿色标示；无显著差异的类群和功能以黄色标示。
如何实现图？
下面使用ggplot2及其扩展工具来实现包珠图（Circular Packing），
✅读入测试数据，
以第一行数据flare.analytics.cluster.AgglomerativeCluster为例，就是展示最外层flare，依次到内层AgglomerativeCluster的层级关系，AgglomerativeCluster节点对应数值为3938。
✅关键代码，
# 关键代码
ggraph(mygraph, layout = 'circlepack', weight=size) +
geom_node_circle(aes(fill = depth)) +
geom_node_text(aes(filter = depth == 1, label = shortName), #这里显示第2层节点标签
size = 5,
color = "white")
✅从以下多方面美化：
geom_node_circle设置区域属性，例如，填充色、区域轮廓size等。 geom_node_text个性化根节点文本 scale_fill_xxx个性化配色等。
美化后效果，
尝试不同的palette，
本期结束！
获取绘图代码+测试数据+数据处理方法+依赖包安装方法，
👇（备注：299）
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