CNS必备UpSet图，这样画，这样看！

本次介绍利用Python matplotlib + UpSetPlot实现CNS常客——Upset图，例如，

UpSet图通过柱状图结合交集指示器，系统化展示集合间的交互和交集数量，特别是在集合数量较多或关系复杂的情况下，能够有效解决Venn图重叠过多的问题，提供更加清晰直观的可视化效果。

如下图，当集合数量为5个、6个和9个时，Upset图清晰直观的效果一目了然。

怎么画图：节选自教程中的第24章👉Python matplotlib保姆级教程，使用章节“3.2.15 set_venn数据集”，展示5组数据UpSet图，核心代码，

# 24.2_01
# -*- encoding: utf-8 -*-
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@Author  :   公众号: pythonic生物人
@Desc    :   24.2 UpSet图
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from upsetplot import from_contents, plot
import matplotlib.pyplot as plt
# 数据准备
organized_data = {
    set_name: set(group['Element'])
    for set_name, group in set_venn.groupby('Set')
}
upset_data = from_contents(organized_data)  #转换为upsetplot支持的数据格式
# 绘图
upset_plot = plot(
    upset_data,  # 传入数据，创建UpSet图
    subset_size='count',  # 显示子集大小，'count'表示显示每个交集的数量
    show_counts=True,  # 显示每个交集的计数
    #show_percentages='{:.1%}',  # 注释掉的代码：显示百分比，'{:.1%}'表示显示为百分比，保留一位小数
    sort_by="cardinality",  # 按交集大小排序，'cardinality'表示按交集元素的数量排序
    sort_categories_by="-cardinality",  # 按原集合大小排序，"-cardinality"表示按集合大小倒序排序
    facecolor="#b1283a")  # 设置UpSet图的背景颜色，"#006a8e"是深蓝色
#个性化设置
upset_plot["intersections"].set_ylabel("集合交集大小")  #设置右上图y轴标题
upset_plot["totals"].set_xlabel("原集合大小")  #设置左图x轴标题
plt.rcParams['figure.dpi'] = 300
plt.title("UpSet图", fontsize=15, y=1.1) #设置标题
plt.gca().grid(False)
plt.gcf().patch.set_edgecolor('gray')  # 设置边框颜色为灰色
plt.gcf().patch.set_linewidth(0.8)  # 设置边框宽度
plt.show()

怎么看图：左半部分是这5组集合数据数量的柱状图，右边下半部分是这些集合数据的交集指示器，有颜色的点的连线就代表有交集，右边上半部分就代表这个交集的数量的柱状图。

如果还是不能理解，看下图，通过同效果的左侧venn图类比右侧upset图。