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Nature medicine全文5主Figure代码!

分享一篇nature medicine s41591-023-02790-x全文代码,值得学习!

Background

尽管辅助化疗可显著改善胰腺导管腺癌(PDAC)术后患者的生存率,但高达50%的患者因术后并发症、身体状态恢复不佳或疾病早期进展而无法接受或完成既定疗程。因此,亟需能够识别出最能从辅助化疗中获益的患者的生物标志物。


Method

  • 队列研究:前瞻性入组1,171名接受胰腺切除术的PDAC患者并进行长期随访。
  • 蛋白质组学分析:对191份样本进行蛋白质组学分析,构建功能蛋白模块,并建立预后风险模型。
  • 生物标志物发现:结合临床和蛋白质组学数据集,通过交互作用回归分析,发现两个生物标志物(NDUFB8和CEMIP2)能指示患者对辅助化疗的整体敏感性。
  • 多层次验证:在内部队列(386例)和两个外部多中心队列(法国队列230例;中国两大顶级医院队列466例)中通过免疫组织化学进行验证。此外,还在PDAC细胞系和患者来源的类器官上进行了功能性实验验证

Result

  • 预后模型:建立了基于蛋白质组学的PDAC预后风险模型,并在外部队列中验证了其效用。
  • 新型生物标志物:NDUFB8和CEMIP2是两个具有广泛应用潜力的生物标志物,能够帮助判断哪些患者更可能从辅助化疗中获益。
  • 临床价值:这项“大队列尺度”的整合研究展示了蛋白质组学指导预后以及生物标志物辅助辅助化疗决策的巨大潜力,为未来实现PDAC的个性化精准治疗提供了强有力的工具和方向。

Figure 代码

包含全套代码:http://www.genetictargets.com/PDAC2BOOKLET/index.html

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全文5张Figure都包含代码,

图5
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图4
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图3
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图2
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图1
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本期结束!


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