审稿人:Minor Revisions,仅图b有点小问题!
本次使用R复现Nature上的broken_axis图!
当数据不在一个数量级上,但又要在一张图上同时反映大数据和小数据的变化规律,需要绘制断裂坐标轴(broken_axis)。
数据
绘图
使用R语言一步步复现一下上图Nature类似图。
✅默认图,
# 基础主图
p <- ggplot() +
# bar plot
geom_col(data = stats, aes(x = age_group, y = mean),
width = 0.4,
fill = "#ff9999", color = "red", alpha = 0.7, size = 1) +
# 误差棒
geom_errorbar(data = stats,
aes(x = age_group, ymin = mean - sem, ymax = mean + sem),
width = 0.15, size = 0.9, color = "red") +
# 抖动散点图
geom_point(data = df,
aes(x = age_group, y = value),
color = "black", fill = "red",
pch = 21, size = 4, alpha = 0.6, stroke = 1,position = position_jitter(width = 0.1)) +
labs(x = "age (weeks)", y = NULL)
p
这是一个bar plot + 误差棒 + 抖动散点图!
存在问题:5-9、10-14的均值分别为2和5、而15-20、21-30组的均值粉呗为35、40,四组数据放在一张图中很不协调,这时候断裂坐标轴(broken_axis)就很有帮助!
✅断裂坐标轴(broken_axis)图,
对15-20、21-30组的进行broken_axis,scale_y_break(c(7, 33))设置断裂区间,
p +
#设置截断区间
scale_y_break(c(7, 33))
这样会协调很多,同时达到相同的目的!
当然和原图存在差异,
比如说统计显著P值添加,
可参考之前的文章👉:复现IF50.0期刊上6张图,换数据即可用!
比如说分面图使用,
可参考之前的文章👉:复现Nature图,换数据即可用!
本期结束!
获取绘图代码+测试数据+数据处理方法+依赖包安装方法,
👇(备注:299)
-推荐阅读-