复现Nature neuroscience期刊图，换数据即可用！

本次使用R语言复现一下Nature neuroscience上的图！

✅读入测试数据

✅复现代码，

ggraph(graph, layout = "fr", niter = 500) +

# 点之间连线
  geom_edge_link(
    aes(
      width = abs(correlation),   # 边宽度
      colour = correlation        # 边颜色
    ),
    alpha = 0.15
  ) +

# 节点设置
  geom_node_point(
    aes(
      size = size,               # 节点大小
      fill = difference          # 节点填充色
    ),
    shape = 21,                  
    colour = "#4d4d4d",         
    stroke = 0.3
  ) +

# 节点标签文字注释
  geom_node_text(
    aes(label = label),         
    repel = TRUE,                
    size = 2.5,                  
    family = "Arial",           
    segment.colour = "grey50",  
    segment.size = 0.2
  )

这张图是一张典型的网络Network图，在原文中表示表达基因之间的网络图。

✅每个圆点代表一个基因

• 圆点大小代表基因的平均表达水平
• 圆点颜色代表基因的差异表达情况 (Difference)，红色表示该基因在比较组间呈上调趋势，绿色表示该基因在比较组间呈下调趋势

✅两个圆点之间连线代两个基因之间的相关性 (Correlation)

• 圆点之间连线颜色代表相关性的方向和强弱
• 圆点之间连线粗细代表相关系数的绝对值大小，越粗相关性越强

总之，这张network图通过形状和颜色展示基因自身的属性（表达量和差异），通过连线展示基因间的互动（相关性）。