用pak快速、便捷的管理R包！

R包的安装一直是困扰许多用户的难题。此前，我们曾介绍过 R 包安装的五种常用方法。

这里再介绍一种pak方法，pak支持从CRAN、Bioconductor、GitHub、URL、Git仓库、本地文件和目录安装 R 包，是 install.packages()和 devtools::install_github()的高效替代方案（可整合之前常见的五种安装方法）。通过多线程处理元数据解析和下载任务，pak提供了快速、安全且便捷的包管理体验。

pak安装

#设置清华镜像，加速安装
options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))
# 从CRAN中安装pak
install.packages("pak")

pak使用

第一次使用需要Updating metadata database，耗时23分钟，比较费时间。

pak安装包时输出的log比较简洁，以安装ggcorrplot为例，

pak安装包时输出的log更简洁，更美观。

后续都以tibble包安装为例，介绍pak常用方法。

• pak从CRAN或Bioconductor安装包

pak 会自动设置与当前 R 版本对应的 CRAN 仓库和 Bioconductor 仓库。

pak::pkg_install("tibble")

• pak从GitHub安装R包

记得添加R包作者，例如，tidyverse/tibble，

("tidyverse/tibble")

• pak从URL安装R包

可替代之前R CMD install, .tar.gz或者.zip的方法。

pak::pkg_install(
"url::https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/tibble/tibble_3.1.7.tar.gz"
)

• 重现安装R包

某个版本的包安装失败了，需要重新安装，使用参数?reinstall，例如，重新安装tibble包，

pak::pkg_install("tibble?reinstall")

• pak安装源代码包（Source Package）

pak::pkg_install("tibble?source")

• pak安装依赖包的最新版本

例如，tibble依赖包cli的最新版本.

pak::pkg_install(c("tibble", "cli=?source"))

• pak忽略升级某些依赖包

例如，忽略升级tibble依赖包DiagrammeR、formattable，

pak::pkg_install(
c("tibble", "DiagrammeR=?ignore", "formattable=?ignore"),
dependencies = TRUE
)

• pak升级所有依赖包

pak::pkg_install("tibble", upgrade = TRUE)

• pak查看所有依赖包（输出data frame结构）

pak::pkg_deps("tibble")

• pak查看所有依赖包（输出树结构）

pak::pkg_deps_tree("tibble")

• pak查看当前使用的下载源

pak::repo_get()

• pak添加下载源

pak::repo_add(rhub = 'https://r-hub.r-universe.dev')
pak::repo_get()

进一步学习：https://github.com/r-lib/pak/