”云雨图“自由！

pythonic生物人2025年05月07日约 2 分钟

云雨图（Raincloud Plot）结合小提琴图/箱图等和散点图，展示原始数据和数据分布。适用于比较组间分布（如 Iris 物种萼片长度）、小样本分析、探索性数据分析及分类数据可视化，常用于生物学、医学和实验研究。

这里使用gghalves结合上文“1.4.8 iris数据集”展示云雨图的制作。

先安装gghalves，

install.packages('devtools')
library(devtools)

devtools::install_github('erocoar/gghalves')

#报错：Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub:
  length(keys) == length(values) is not TRUE

#下载gghalves源码https://github.com/erocoar/gghalves/archive/refs/heads/master.zip到本地/Users/xx/Desktop/gghalves-master.zip

# devtools::install_local安装
devtools::install_local("/Users/xx/Desktop/gghalves-master.zip")

下面举两个例子，细节见代码注释。

左右云雨图

library(gghalves)

ggplot(iris_data, aes(x = species, y = sepal_length, fill = species)) +

# 添加右侧半边小提琴图，显示萼片长度分布，透明度 0.8
  geom_half_violin(aes(fill = species), side = "r", alpha = 0.8) +

# 添加左侧散点图，显示数据点，带边框圆形，大小 3，边框线宽 0.5，透明度 0.8
  geom_half_point(aes(fill = species), side = "l", shape = 21, size = 3, stroke = 0.5, alpha = 0.8) +

# 设置填充颜色为自定义颜色向量 custom_colors1
  scale_fill_manual(values = custom_colors1) +

# 应用自定义主题控制图表外观
  custom_theme

上下云雨图

library(gghalves)

ggplot(iris_data, aes(x = species, y = sepal_length, fill = species)) +

# 添加右侧半边小提琴图，显示萼片长度分布，透明度 0.8
  geom_half_violin(aes(fill = species), side = "r", alpha = 0.8) +

# 添加左侧散点图，显示数据点，带边框圆形，大小 3，边框线宽 0.5，透明度 0.8
  geom_half_point(aes(fill = species), side = "l", shape = 21, size = 3, stroke = 0.5, alpha = 0.8) +

# 翻转坐标轴，使物种显示在 y 轴，萼片长度在 x 轴，形成上下布局
  coord_flip() +

# 设置填充颜色为自定义颜色向量 custom_colors1
  scale_fill_manual(values = custom_colors1) +

# 应用自定义主题控制图表外观
  custom_theme