这个工具出手就是CNS级水准！师妹师弟都在偷偷用！

分享一个强大的R工具—scop，scop是single-cell omics data分析工具合集，包含scRNA-seq和 scATAC-seq data等分析方法，围绕Seurat对象构建，少量代码完成你的任务！

使用一下scop

• Differential expression analysis

pancreas_sub <- RunDEtest(
  srt = pancreas_sub,
  group_by = "CellType",
  fc.threshold = 1,
  only.pos = FALSE
)
VolcanoPlot(
  srt = pancreas_sub,
  group_by = "CellType"
)

• Enrichment analysis

• CellDimPlot

• CellStatPlot

• Other visualization

• Cell annotation using single-cell datasets

ht <- CellCorHeatmap(
  srt_query = pancreas_sub,
  srt_ref = panc8_rename,
  query_group = "SubCellType",
  ref_group = "celltype",
  nlabel = 3,
  label_by = "row",
  show_row_names = TRUE,
  show_column_names = TRUE
)
print(ht$plot)

更多。。。。。。：https://github.com/mengxu98/scop

推荐《👉保姆级R可视化教程》，39个章节，数百张图，旨在引导如何系统学习R语言可视化，部分展示如下：

（加入学习，收费，备注：299）