pythonic生物人

复现Science正刊图,换数据即可用!

本次使用R语言复现一下Science正刊中的1张图!

science.adr0351,Fig.1 A原图
science.adr0351,Fig.1 A原图
❤️复现效果图-A图❤️
❤️复现效果图-A图❤️

✅读入测试数据,

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原图主要由世界map + 散点图组成,散点表示全球海洋鱼类体内污染物浓度。

✅R语言一步一步实现,

🔸绘制世界map,

ggplot() +
# 绘制世界地图
  geom_polygon(
    data = world_map,
    aes(x = long, y = lat, group = group),  # 多边形坐标和分组
    fill = "#f3f3f3",    # 浅灰色填充
    color = "#939393",   # 灰色边框
    linewidth = 0.3# 边框线宽
  )
Image

🔸添加散点图,

geom_point(
    data = concentration_data,
    aes(
      x = lon,           # 经度
      y = lat,           # 纬度
      fill = conc_group, # 按浓度组填充颜色
      size = conc_group  # 按浓度组设置点大小
    ),
    shape = 21,          # 实心圆点形状
    color = "black",     # 黑色边框
    stroke = 0.5,        # 边框粗细
    alpha = 0.9# 透明度
  ) 
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🔸个性化填充色,

# 填充颜色
  scale_fill_manual(
    name = "Concentrationn(ng/g ww)",  # 图例标题
    values = conc_colors,               # 使用预定义颜色
    drop = FALSE# 保持所有因子水平
  ) +
# 点的大小
  scale_size_manual(
    values = c(2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5),  # 7个浓度区间对应的大小
    guide = "none"# 不显示大小图例
  ) +
# X轴(经度)设置
  scale_x_continuous(
    name = NULL,                            # 不显示轴标题
    breaks = c(-120, -60, 0, 60, 120, 180), # 刻度位置
    labels = c("120°W", "60°W", "0°", "60°E", "120°E", "180°"),  # 刻度标签
    expand = c(0.01, 0.01)                  # 轴两端扩展
  ) +
# Y轴(纬度)设置
  scale_y_continuous(
    name = NULL,                        # 不显示轴标题
    breaks = c(-30, -60, 0, 30, 60),    # 刻度位置
    labels = c("30°S", "60°S", "0°", "30°N", "60°N"),  # 刻度标签
    expand = c(0.01, 0.01)              # 轴两端扩展
  )
Image

🔸个性化theme,

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🔸个性化坐标系统,

# 坐标系统
  coord_fixed(
    ratio = 1.3,        # 宽高比
    xlim = c(-180, 180), # 经度范围
    ylim = c(-60, 85)   # 纬度范围
  ) 
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🔸图例设置,

final_plot <- plot_grid(
  main_plot,      # 主图
  legend,         # 图例
  ncol = 2,       # 2列布局
  rel_widths = c(8, 1.2),  # 主图宽度8,图例宽度1.2
  align = "h"# 水平对齐
)

# 显示最终图形
print(final_plot)
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本期结束!


获取绘图代码+测试数据+数据处理方法+依赖包安装方法,

👇(备注:299)

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-END-
更多干货👉再更新10个章节,《保姆级R可视化教程3.0》来了!49个章节,200+张图,旨在引导如何系统学习R语言可视化,部分展示如下:
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复现效果图-abcd图❤️
复现效果图-b图❤️
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❤️复现效果图-ABCD图❤️
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❤️复现效果图-bcd图❤️
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❤️复现效果图-b图❤️
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(加入学习,收费,备注:299)

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