OpenAI重磅发布,轻松将Codex打造成Co-Scientist
大家好,我是pythonic生物人。
前天,OpenAI发布生命科学领域Rosalind Workbench,将自家今年4月份发布的GPT-Rosalind👉OpenAI推出垂直领域模型GPT-Rosalind模型打造成界面层产品。
数据碎片化、工具脱节、实验记录不清晰都会阻碍科学研究:数据可能在一个地方,分析结果在另一个地方,而实验过程的记录又可能在另一个地方。遵循证据意味着在决定下一步研究方向时,要将这些碎片信息连接起来。
Rosalind Workbench的目的——将这些工作整合到一个环境中。
Rosalind Workbench到底能干什么?
入门界面提供涵盖蛋白质设计、小分子设计、安全性和可开发性、结构和序列、基因组学和病理学以及实验验证等方面的研究任务。
以上不同的研究任务使用不同的数据和方法,但其根本需求往往是相同的:将生物学问题与正确的证据联系起来,并明确下一步决策的路径。
Viewer
Rosalind Workbench为每个方向都配了专业查看器(Viewer),这些专用查看器允许您在同一对话中查看科学数据和分析结果。
您可以查看细节、提出后续问题,并将所看到的内容与分析结果保持关联。
例如,演示案例中,一位科学家研究了与司美格鲁肽结合的GLP1R的结构。他们引导模型与查看器互动,解释PDB文件中的结构特征,并制作了一段视频来展示蛋白质复合物的关键特征。
分子结构查看器(Molecular Structure Viewer)
生物序列与比对查看器(Biological Sequence & Alignment Viewer)
病理切片查看器(Slide Viewer)
Rosalind NGS Workbench
另外,由于基因组数据分析“通常需要许多相互关联的决策和数据集,才能解读生物学结果。文件必须与元数据匹配,必须评估质量,必须确定正确的生物学重复样本,并且必须选择合适的统计设计。”
他们做了一个Rosalind NGS Workbench,有助于将这些步骤连接成一个可审核的流程。
从FASTQ输入到QC、bulk RNA-seq或single-cell RNA-seq等分析,Rosalind会制定计划供研究人员批准,协调所选工具,并返回可追溯、可审查的输出结果。
这妥妥的一个生物信息科学家。
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